1.第1聯合工會小組（辦公室、科研處、人事處）（含方輝所長、萬一兵書記）：黃勵
2.第2聯合工會小組（財務處、基建條件處）（含高建芳副所長）：顧怡
3.第3聯合工會小組（成果轉化處、后勤處）：朱瑩
4.第4聯合工會小組（漁業信息與經濟研究中心、長江口與東海漁業戰略研究中心）：王茜
5.漁業生態環境研究室工會小組：蔣玫
6.水產品質量安全與加工研究室工會小組：顧潤潤
7.漁業資源研究室工會小組（含程家驊副所長）：李建生
8.水產養殖技術研究室工會小組：王元
9.捕撈與漁業工程研究室工會小組（含王魯民副所長）：陳曉雪
10.遺傳育種與生物技術研究室工會小組：王倩
11.漁業遙感與信息技術研究室工會小組：李家勝
12.河口與近岸漁業生態研究室工會小組：黃曉榮
13.調查船管理中心工會小組：徐捷
14.實驗基地管理中心工會小組：周帥
