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中國水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所是國家綜合性漁業(yè)研究機構(gòu)。本部位于上海市楊浦區(qū)，占地面積約2.2萬平方米，在上海奉賢、海南瓊海、福建福鼎、江蘇贛榆和浙江寧海分別建有實驗研究基地。

研究所創(chuàng)建于1958年10月，歷經(jīng)中國科學(xué)院上海水產(chǎn)研究所、上海市水產(chǎn)研究所、水產(chǎn)部東海水產(chǎn)研究所、上海市海洋漁業(yè)公司東海水產(chǎn)研究所、國家水產(chǎn)總局東海水產(chǎn)研究所等發(fā)展時期，1982年10月統(tǒng)一劃歸中國水產(chǎn)科學(xué)研究院管理。2003年進入國家科技創(chuàng)新體系（國家非營利性科研機構(gòu)）；2005年通過中國質(zhì)量認證中心ISO9001質(zhì)量管理體系認證，成為我國漁業(yè)科研系統(tǒng)第一個進入ISO9001質(zhì)量管理體系的單位。

研究所承擔(dān)我國漁業(yè)發(fā)展中的全局性、基礎(chǔ)性、關(guān)鍵性和方向性的重大科技任務(wù)，為我國漁業(yè)科技進步、行業(yè)管理和產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供服務(wù)。主要開展遠洋與極地漁業(yè)資源開發(fā)、河口與近海漁業(yè)生態(tài)學(xué)、漁業(yè)資源保護及利用、捕撈與漁業(yè)工程、漁業(yè)生態(tài)環(huán)境評價與保護、水產(chǎn)養(yǎng)殖技術(shù)、水產(chǎn)遺傳育種與生物技術(shù)、水產(chǎn)品加工與質(zhì)量安全、漁業(yè)信息與戰(zhàn)略等研究。經(jīng)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部批準的中國水產(chǎn)科學(xué)研究院發(fā)展規(guī)劃中確定將我所建成國家級遠洋和河口漁業(yè)研究中心。

研究所擁有一支學(xué)科結(jié)構(gòu)合理、業(yè)務(wù)素質(zhì)較高，具有雄厚實力的漁業(yè)科研隊伍。全所編制職工450人，現(xiàn)有研究員30余名，副研究員60余名，國家新世紀百千萬人才工程國家級人選3人，享有國務(wù)院政府特殊津貼的專家28人，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部有突出貢獻的中青年專家5人，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院首席科學(xué)家3人，上海市領(lǐng)軍人才4人，上海市農(nóng)業(yè)領(lǐng)域領(lǐng)軍人才2人。研究所與上海海洋大學(xué)、華東師范大學(xué)、中國海洋大學(xué)、中國科學(xué)院海洋研究所和大連海洋大學(xué)等院校建立聯(lián)合招收培養(yǎng)研究生機制，每年在讀研究生達100余名。經(jīng)人事部和全國博士后管理委員會批準，建立博士后科研工作站。

研究所擁有農(nóng)業(yè)農(nóng)村部等各級重點實驗室及平臺16個，300噸級漁業(yè)資源調(diào)查船2艘，3000噸級海洋漁業(yè)綜合科學(xué)調(diào)查船1艘，現(xiàn)有科學(xué)儀器設(shè)備數(shù)量3300余套，主辦學(xué)術(shù)期刊《海洋漁業(yè)》和《漁業(yè)信息與戰(zhàn)略》。