近日，我所擬穴青蟹項(xiàng)目組在擬穴青蟹轉(zhuǎn)錄組高通量454測(cè)序、組裝與注釋、信號(hào)通路分析、分子標(biāo)記挖掘及與生長(zhǎng)性狀相關(guān)的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選研究中取得一系列新進(jìn)展，研究成果相繼發(fā)表在PLoS ONE、Molecular Biology Reports、Gene等國(guó)際期刊上。
擬穴青蟹屬大型海水蟹類，是我國(guó)重要的海水養(yǎng)殖和捕撈對(duì)象。項(xiàng)目組在國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、上海市科委基礎(chǔ)研究重點(diǎn)項(xiàng)目、中央級(jí)科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)項(xiàng)目等資助下，利用454二代測(cè)序技術(shù)對(duì)擬穴青蟹轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了深度測(cè)序，現(xiàn)已獲得540 Mbp的數(shù)據(jù)量、131萬(wàn)條高質(zhì)量reads、76000多條contigs及78000多個(gè)unigenes；同時(shí)，還鑒定出1.9萬(wàn)多個(gè)微衛(wèi)星序列和3.6萬(wàn)多個(gè)SNP位點(diǎn)。
項(xiàng)目組針對(duì)轉(zhuǎn)錄組來(lái)源的信息進(jìn)行深入挖掘和應(yīng)用，共開(kāi)發(fā)出164個(gè)多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記，驗(yàn)證了91個(gè)SNP位點(diǎn)，獲得了線粒體全基因組序列，其中3個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記(Scpa36、Scpa75、Spm30)與12個(gè)表型生長(zhǎng)性狀之間具有顯著的相關(guān)性(P < 0.05)，初步確定了Scpa36位點(diǎn)的BC基因型、Scpa75位點(diǎn)的BC和BD基因型及Spm30位點(diǎn)的AC基因型在擬穴青蟹選擇育種中具有最大的輔助育種潛力。
該研究將促進(jìn)擬穴青蟹及其相近物種的功能基因組學(xué)、種群保護(hù)遺傳學(xué)和分子輔助育種學(xué)研究的發(fā)展。
（遺傳育種與生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室 馬洪雨）
