針對我國東海區和長江口具重要經濟價值的水動生物，開展種質資源挖掘、新品種開發、健康苗種繁育技術和生態養殖技術研究；建立和完善水產動物功能基因組研究、種質資源研究、分子標記輔助育種和分子生態學研究的技術平臺，開展生長、抗逆相關的功能基因的開發和利用研究、種質資源保護研究以及遺傳育種學研究等工作，在名、特、優水產動物新品種開發、苗種繁育技術、遺傳育種等研究方向取得突破。
主要研究方向：
1、東海區優異水生動物種質資源開發與利用
2、東海區重要經濟水產動物種苗繁育技術研究
3、東海區重要經濟水產動物品種選育技術研究
發展目標：開發名、優、特海洋養殖新對象，完善和熟化水產養殖動物的大規模和高密度苗種繁育技術，構建遺傳育種技術平臺，建立以結構合理、具創新能力的研究團隊，為海水養殖業的健康有序發展提供苗種繁育和遺傳育種的新技術和新產品。
