隨著沿岸大量海洋工程建設，來自陸源海源污染增加，東海漁業環境與生態問題呈明顯惡化趨勢，在全球變暖的背景下，漁場安全研究也將成為國內外研究的熱點。為此，東海區漁業環境評價與生態安全預警功能實驗室將集中開展東海漁業水域生態系統變化特征和趨勢的研究，通過環境監測、評價和生態安全預警及針對性的生態修復，為東海漁業水域的管理，明顯影響漁業環境項目的準入，漁業保護區設置等漁業管理措施制定和管理提供有效的技術支持。
主要研究方向：
（1）河口、海灣、灘涂漁業水域環境監測、診斷、評價與預警研究
（2）漁業污染生態學和生態環境安全基礎研究
（3）漁業水域生態環境保護、修復和管理研究
發展目標：
建立東海漁業環境基本要素的數據空，研究判別分析等多元分析方法，籍此實現針對東海漁業水域生態安全系統的預測，并通過建立東海自然生態安全發展度評價模型及梯度預警區間，最終實現其不安全狀態的動態預警。針對性地提出東海漁業水域生態修復的科學對策，針對不同水域餌料基礎環境和水平，提出相應的放流措施，從而為東海漁業水域功能劃分，漁業的可持續發展和有效管理提供技術支持。
