水產養殖技術研究室主要開展水生生物的耐鹽堿生物學和鹽堿養殖生態系統研究，發展完善鹽堿養殖環境質量優化與控制技術，建立鹽堿水養殖規?；c標準化關鍵技術體系，探索鹽堿水土資源的漁業綜合利用；基于東海區不同養殖模式開展養殖生物學和生態學研究，建立健康高效養殖技術體系；開展養殖生物營養需求研究，開發新型飼料添加劑、營養強化劑與免疫增強劑，形成養殖生物品質調控技術；開展水產養殖病原生物學、致病機制和流行機制研究，建立增殖放流水生動物疫病檢測技術與標準；開展漁用新型藥物藥動學、作用機制和新藥創制研究，水生甲殼動物先天免疫與抗感染免疫調控研究，研發抗菌肽和寡肽等病控產品，建立水產養殖微生物的藥物抗性評價標準和風險評估。
