東海水產研究所漁業資源研究室，重點開展東海漁業資源的動態調查監測與評價、漁業生物實驗生態、種質資源、人工海洋牧場規劃設計與效果評價、增殖放流效果評價、海洋捕撈日志的自動采集與分析處理、漁船的可視化監控、東海生態漁業管理措施與策略的決策咨詢等公益性工作，為近海漁業資源的可持續利用和養護提出理論依據和技術支撐。本研究室擁有一支從事海洋漁業資源與生態研究的多學科學人才組成的科研隊伍，堅持基礎性、前瞻性和戰略性的原則，瞄準科學發展目標和國家需求，不斷增強科技創新能力，力爭成為具有一流水平、高效運行、全面開放和可持續發展的漁業資源養護研究中心和漁業資源研究創新平臺。
研究內容：
魚類分類學、漁業基礎生物學、種群動力學、漁業資源評估與管理、河口和海洋生態系統動力學與漁業資源的可持續利用、漁業信息化、漁業資源增殖放流和生態安全、遠洋和極地漁業資源開發利用。
主要研究成果：
20世紀50年代末以來，先后承擔了東海漁業資源普查、東黃海中上層魚類資源調查、東海大陸架外緣和大陸斜坡深海漁場綜合調查、東海北部及毗鄰海區綠鰭馬面鲀等底層魚類資源調查與探捕、東黃海及外海遠東擬沙丁魚資源調查和開發利用、幾內亞比紹共和國大陸架漁業資源調查以及國家海洋勘探專項等重點研究項目20余項；開發利用了東黃海鮐鲹魚、擬沙丁魚、馬面鲀、東海魷魚等漁業資源。開展了魚類型態、地理分布、區系特征等魚類學研究，發表新種50多種；擁有館藏魚類標本1700多種、10000余瓶；曾獲多項國家科技進步獎、農業部科技進步獎、上海市科技進步獎；先后出版了十余部專著，發表了300多篇學術論文。
